南京师范大学研究生院是全国首批双一流建设高校研究生教育示范基地之一，努力将学校打造成具有高水平、国际化和特色的研究生教育基地，为培养更多高素质的创新型人才做出贡献。截至2021年，该院已有各类研究生1.4万余人，覆盖了150多个本硕博专业和数个博士后流动站，是江苏省规模最大、级别最高、学科门类最全的研究生教育机构之一。
南京师范大学研究生院教学科研水平优良。目前有二级学科24个，在全国28个学科排名中，21个学科排名进入ESI前1%。研究生导师队伍庞大，拥有教授、硕士生导师、博士生导师多达1800余名，其中还有诺贝尔奖得主、长江特聘教授、国家杰出青年基金获得者等高层次人才。与此同时，研究生院还积极开展学科交叉与融合，全力打造新型学科方向。
南京师范大学研究生院还重视质量与服务相结合。他们不仅在加强入学考试制度、落实导师责任制、推行学术诚信体系建设等方面，确保研究生培养质量。还注重服务，提供包括心理辅导、就业指导、学术交流等各种服务，全方位保障研究生学习和生活。