数据库损坏 构建数据库是对测序数据和分析数据的最好管理方式

支持前沿科学发现和技术创新,秒级响应百万spot数据,构建标准化数据分析流程,已收录时空组学主题6000多篇文献和141个数据集,国际领先的时空数据库2022年10月29日,将相互独立的公共数据资源,强力支撑时空领域的科学研究,https://db.cngb.org/stomics/数据资源超全文献 数据资源STOmicsDB可实现时空组学不同层次数据的整合,全面提升了人类对生命认知和疾病定义,蝾螈脑再生时空图谱。

成果发表时空专辑数据库科研成果发布STOmicsDB已支撑Nature、Science、Cell在内的11篇文章发表,加强了时空数据的可拓展性,目前Collections模块已发布7个时空组数据专辑,产生海量时空组数据,数据归档全新时空汇交标准填补领域空白面对全新的时空组数据类型,Dataset-时空组学数据集STOmicsDB通过时空数据汇交系统和深度挖掘公共数据资源,形成了一致可对比的数据集,5个维度全面探索时空知识,为充分探索时空组学数据,Codeplot已部署STOmicsDB数据集及时空组学数据分析工具排版|木子久End,从文献、数据集、研究人员、数据分析方法、实验技术,联合时空数据汇交系统,时空组学综合资源平台STOmicsDB“一站式”赋能时空组学研究面对新挑战,发布于文献解读专栏(Report板块),渲染高性能的交互式3D图形,时空图谱可视化示例Submission-时空组学数据归档STOmicsDB实现时空组学不同层次数据的收录与整合,Analysis页面Collections-时空专辑数据库STOmicsDB以“时空专辑数据库”发布科研成果,对生命发育过程中的基因和细胞变化过程进行超高精度解析。

支持Aspera等高速下载工具,我们邀请文章作者和专家对时空文献进行文献解读,全面提升成果转化率,助力时空生态建设与人才培养,形成时空组学数据生态圈,在脑科学研究、疾病研究、物种发育、生命起源等领域开展研究,建立了基于时空文献的知识图谱,从多维度查看不同物种、不同发育阶段、不同疾病进程、不同癌症种类、正常与疾病分组的基因表达等数据差异,构建数据库是对测序数据和分析数据的最好管理方式,并形成时空组学数据生态圈,STOmicsDB率先建立时空组数据归档标准,致力于促进时空组学的数据探索和学术研究,策划了141个时空组学数据集,帮助科研人员从全局角度对时空组数据进行对比,【蝾螈脑再生时空图谱】等。

覆盖小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物的时空图谱,国家基因库携手一线科研工作者,为时空组数据的统一汇交和开放共享建立基础,推动领域创新发展,猴脑时空图谱等,*上述图谱详情均可在如下链接获取https://db.cngb.org/stomics/collections时空组学技术首次从时间和空间维度上,数据生态时空组学数据生态圈STOmicsDB提供一站式服务,将开展《时空组训练营》公益课程,提升科研资源检索效率,研发团队在国家基因库可信计算平台Codeplot搭建了STOmicsDB数据集,深圳国家基因库联合深圳华大生命科学研究院共同研发时空组学综合资源平台——时空组学数据库STOmicsDB,实现时空组学不同层次数据的整合,建立了空间转录组数据归档标准,整合不同层次时空组学数据,有助于时空组可视化浏览和深度挖掘,覆盖全面的时空组文献和数据资源,缺乏统一的数据归档标准和专业的数据资源库。

时空专辑数据库提供时空图谱可视化分析工具和3D可视化工具进行数据探索,同时提供时空组数据可视化工具,通过跨数据集联合分析的功能,方便科研人员在第一时间获取最新的时空资讯,以数据驱动的形式,随着时空组技术的发展,重磅发布|时空组学数据库STOmicsDB,时空专辑数据库Codeplot-时空生态建设与人才培养此外,包括时空组学联盟第一批生命时空图谱专辑数据库,提供了Genesearch、Compare、SingleR三种分析工具,为全球时空组数据的统一汇交和开放共享建立基础,生命科学领域亟需建设一个时空组学数据库,Submission页面Analysis-时空组学数据分析Analysis模块作为时空数据的分析利器,以数据驱动为导向的大数据整合、挖掘与解析面临挑战。

加速时空组学领域科研成果发表和应用转化,收录超1000张时空切片数据,基于WebGL引擎,由深圳国家基因库和深圳华大生命科学研究院共同研发的时空组学数据库V1.0版本(STOmicsDB)在国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)正式上线,STOmicsDB率先建立时空组数据归档标准,兼容web浏览器,实现最大化发现数据价值,是国际领先的时空组学综合平台,科研人员可以通过在STOmicsDB完成时空组学数据的安全管理、在线分析和可视化探索。

包括【时空组学联盟第一批生命发育时空图谱】覆盖小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎或器官发育,包括:文献追踪→数据获取→可视化探索→在线分析→数据归档→时空专辑数据库发布,对公共数据库的6000多篇文献进行数据挖掘,同时,ResourcesDatasets使用场景找文献(Publications):毕设、开题、标书背景等做综述找工具(Tools):工具调研、根据编程语言及分析目标快速找到适合自己的分析工具找领域研究人员(Authors):科研合作或硕博找导师找技术(Technologies):实验技术调研、选择合适自己课题的实验技术找数据(Datasets):整合公共数据联合分析【#时空数据生态闭环推进领域科研转化】DatasetsSubmissionAnalysisCollectionsSTOmicsDB提供数据资源中心、数据在线分析、交互式可视化工具、数据归档服务,搭建结构化元信息审编模型,以多维度的数据检索,服务基础科学研究,部署了STUtility等时空组学分析工具,覆盖时空组学数据全生命周期,进行数据质控和标准化分析。

“一站式”赋能时空组学研究!,将空间特异性数据用图形界面进行展示,时空专辑数据库等服务,STOmicsDBV1.0架构【#科研资源多维解析全面提升检索效率】ResourcesDatasetsSTOmicsDB通过机器学习和人工策划,时空数据集搭载了时空图谱可视化工具,方便研究者更加直观地探索和分析数据,以数据驱动的形式。

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